จำแนกผีเสื้อเหยี่ยวด้วยบาร์โค้ดพันธุกรรม

การจำแนกชนิดของสิ่งมีชีวิตด้วยบาร์โค้ด DNA จะทำได้ดีเมื่อมีแหล่งอ้างอิงข้อมูล DNA ของแต่ละสปีชีส์อย่างสมบูรณ์แล้ว แต่หากไม่มีข้อมูลลำดับเบสของสปีชีส์ที่ต้องการศึกษาอยู่ในฐานข้อมูลแล้ว จะสามารถจำแนกสิ่งมีชีวิตตัวอย่างในระดับทางอนุกรมวิธานที่สูงขึ้นกว่าระดับสปีชีส์แทนได้หรือไม่

นักวิทยาศาสตร์ถกเถียงกันถึงเรื่องการใช้ฐานข้อมูลที่ไม่เหมาะสมในการจำแนกสปีชีส์ในระดับของอนุวิธานอื่นๆได้ แต่มันจะมีประสิทธิภาพดีแค่ไหน หรือเชื่อได้หรือไม่

ความแม่นยำในการจัดจำแนกสปีชีส์ในระดับสูงกว่าสปีชีส์ในภาวะที่ฐานข้อมูลไม่มีลำดับสารพันธุกรรมของสปีชีส์นั้นอยู่เลย จะขึ้นอยู่กับความสมบูรณ์ของฐานข้อมูลที่เป็นอยู่ในขณะนั้นและเกณฑ์ที่ใช้ในการจำแนก แต่ก็ไม่เคยมีใครได้ลงมือศึกษาผลของสองปัจจัยนี้อย่างจริงจัง

ทีมนักวิจัยนานาชาติคิดวิธีศึกษาขึ้นมาได้ว่า หากเปลี่ยนแปลงระดับความสมบูรณ์ของฐานข้อมูลที่มีอยู่แล้ว เช่นในกรณีนี้ ทีมผู้วิจัยใช้ฐานข้อมูลสำหรับการทำบาร์โค้ด DNA ของผีเสื้อเหยี่ยว (Sphingidae) ที่เรียกได้ว่าแทบจะสมบูรณ์แล้วด้วยจำนวนสปีชีส์กว่า 1,095 สปีชีส์ แล้วใช้ข้อมูลของผีเสื้อเหยี่ยวแห่งคอสตาริก้า ซึ่งมีอยู่ 118 ชนิดที่ได้รับการศึกษาแล้วเป็นอย่างดีและหลากหลายมาเป็นตัวสืบค้น

ฐานข้อมูลจะถูกนำมาจำลองว่าสมบูรณ์จากน้อยไปถึงมาก (10%-100%) แล้วค้นด้วยข้อมูลที่มีเพื่อดูว่าผลการค้นหาในฐานข้อมูลนั้นพบสปีชีส์หรือไม่ และแม่นยำแค่ไหน (ถูกต้องหรือไม่ถูกต้องอย่างไร) ภายใต้เกณฑ์ต่างกันหกแบบ

ผลที่พบก็คือหากใช้เกณฑ์แบบหนึ่งจะพบว่าจะสามารถระบุถึงสกุล (genus) เผ่าพันธุ์ (tribe) และวงศ์่ย่อยในระดับความแม่นยำที่แตกต่างกัน เมื่อใช้เกณฑ์ที่หย่อนยานมากขึ้น จำนวนการจำแนกที่ถูกต้องจะเพิ่มขึ้นแต่ในขณะเดียวกันการจำแนกได้แต่ผิด (false positive) ก็เพิ่มขึ้นเช่นเดียวกัน

นักวิจัยพบว่าการเลือกใช้เกณฑ์ที่เหมาะสมจะทำให้มีโอกาสจัดจำแนกตัวอย่างได้ถูกต้องมากกว่า โดยไม่ขึ้นอยู่กับความสมบูรณ์ของฐานข้อมูล ซึ่งนั่นแสดงให้เห็นว่าหากฐานมูลยังไม่สมบูรณ์พร้อมแล้วนั้น เราก็ยังสามารถใช้การทำบาร์โค้ด DNA ในการจำแนกตัวอย่างในระดับสูงกว่าสปีชีส์ได้ด้วยความถูกต้องระดับหนึ่งก่อนอยู่ดี

อ้างอิง

One thought on “จำแนกผีเสื้อเหยี่ยวด้วยบาร์โค้ดพันธุกรรม

ใส่ความเห็น

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / เปลี่ยนแปลง )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / เปลี่ยนแปลง )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / เปลี่ยนแปลง )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / เปลี่ยนแปลง )

Connecting to %s